微生物与每个人都息息相关的是人类微生物群系（Human microbiome）。

这些微生物与人存在一种共生互惠的关系。

人类微生物组计划开展了人类微生物群基因组测序项目，特别关注通常栖息在皮肤，口腔，鼻子，消化道和阴道的微生物群落。

以肠道菌群为例，肠道菌群，作为寄居在人体肠道内微生物的总称，是近年来科学研究焦点之一。

一个成年人的细胞数量大约是数十万亿的量级，而肠道菌群的细胞总量是人细胞数的十倍。编码基因综述是人的100倍。

肠道菌群失调与营养不良、肥胖症、糖尿病等疾病息息相关。

所以这里要提醒各位，切勿滥用抗生素，抗生素也会将肠道内共生菌杀掉，对肠道菌群造成严重影响。一旦失衡的菌群难以恢复，就需要进行粪便移植了。

微生物与日常生活的吃吃喝喝相关。

任何通过发酵处理或工艺制造的食品饮品都离不开微生物。馒头、面包、酒（白酒、啤酒、红酒、黄酒等各种酒）、醋、酱油、酸奶等等，以及风味小吃臭豆腐、毛豆腐、臭鳜鱼。

疫苗，按照制备工艺分不含活微生物体的疫苗和含有活微生物体的疫苗。前者包括各种灭活疫苗、组分疫苗等，如将病原微生物灭活后保留全微生物体做成的疫苗。如甲肝灭活疫苗、日本脑炎灭活疫苗、脊灰灭活疫苗、流感（全病毒）疫苗等灭活疫苗；采用病原微生物表面的有效抗原制备的组分疫苗，如肺炎球菌疫苗、脑膜炎球菌疫苗、流感嗜血杆菌疫苗、流感（裂解或亚单位）疫苗、霍乱疫苗、伤寒疫苗等。胰岛素，一型糖尿病人需要注射胰岛素，然而从动物或人体提取胰岛素显然不能满足需求。

1978年，由Arthur Riggs, Keiihchi Itakura和 Herbert Boyer首次在大肠杆菌中表达人胰岛素。抗生素，由微生物（包括细菌、真菌、放线菌属）所产生的具有抑制其它类微生物生长、生存的一类次级代谢产物，以及用化学方法合成或半合成的类似化合物。

有的人怎么吃都吃不胖，有的人却喝点水都能长胖，你知道这是为什么吗?如果一个小孩有明显的社交障碍，仅仅劝他打开心扉就可以了吗?实际上，只有清楚了微生物在我们体内扮演的角色，我们才对这些问题有明智的答案。

人确实有体质胖瘦之分，肥胖体质的人和苗条体质的人，体内的微生物组大不一样。科学家们将肥胖小白鼠排泄物中的微生物提取出来，移植到无菌的普通小白鼠身上，这些普通小白鼠并没有改变饮食和其他活动习惯，但很快却变得越来越胖。相反，从消瘦的小白鼠的排泄物里分离出微生物菌群，移植到肥胖小白鼠身上，胖子也能变苗条。

抑郁症是一种心理和生理的双重疾病，它的产生跟一种叫颤杆菌的细菌有关。颤杆菌会产生一种功能类似于天然镇静剂的化学物质，模仿神经递质的作用，降低脑部的神经活动，从而导致我们抑郁。

自闭症普遍被认为是一种心理疾病，它的产生跟我们肠道内的脆弱拟杆菌相关，这种细菌在患自闭症的儿童体内数量较少。将人体内脆弱拟杆菌注入到有自闭症状的小白鼠体内，患有自闭症症状的小白鼠，它们的焦虑程度显著降低，重复消极的行为也明显减少。